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--- fr:manuel_reference:methode_micro:verif_habby [2021/11/29 14:27] – ylecoarer
+++ fr:manuel_reference:methode_micro:verif_habby [2021/12/02 10:34] – ylecoarer
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 Pour une variable donnée, et pour des valeurs discrètes de celle-ci, le modèle biologique fourni des préférences SI à valeur entre 0 et 1, qualifiant 'la préférence' du poisson, la courbe de préférence est ainsi construite.
-L'équation (1) permet de calculer la valeur d'habitat  $\mathit{HSI_i}$ dans une maille d'indice i  et d'aire Ai d'une modélisation hydraulique, à partir des valeurs moyennes des variables (H,V,S) de cette maille notés  $\mathit{H_i,V_i,S_i}$.
+L'équation (1) permet de calculer selon les options de calcul utilisateur la valeur d'habitat  $\mathit{HSI_i}$ dans une maille d'indice i  et d'aire Ai d'une modélisation hydraulique, à partir des valeurs moyennes des variables (H,V,S) de cette maille notés  $\mathit{H_i,V_i,S_i}$.
+(1_a) \[HSI_i=SI_H(H_i)\times SI_V(V_i)\times SI_S(S_i)\]
+(1_b) \[HSI_i=(SI_H(H_i)\times SI_V(V_i)\times SI_S(S_i))^\frac{1}{3}\]
+(1_c) \[HSI_i=\frac{SI_H(H_i)+ SI_V(V_i)+ SI_S(S_i)}{3}\]
+Dans le cas ou l'utilisateur décide de n'utiliser que deux variables par exemple (H,V), ces équations sont adaptées dans HABBY et deviennent :
+(1_a2) \[HSI_i=SI_H(H_i)\times SI_V(V_i)\]
+(1_b2) \[HSI_i=(SI_H(H_i)\times SI_V(V_i))^\frac{1}{2}\]
+(1_c2) \[HSI_i=\frac{SI_H(H_i)+ SI_V(V_i)}{2}\]
+Les logiques (a) produit, (b) moyenne géométrique et (c) moyenne sont respectées.
+Dans le cas ou le modèle biologique est bivarié (H,V) l'équation (1) s'écrit :
+(1_biv) \[HSI_i=SI_{H,V}(H_i,V_i)\]
-(1) \[HSI_i=SI_H(H_i)\times SI_V(V_i)\times SI_S(S_i)\]
 (2) \[WUA=\sum_{i=1}^M A_i\times HSI_i\]
 (3) \[OSI=\frac{WUA}{\sum_{i=1}^M A_i}\]
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   * Utilisez MAJ+clic sur {{:wiki:see_project.png?30|}} : pour ouvrir le répertoire d’installation d’HABBY.
   *  Allez dans le répertoire \habby\biology\models et ouvrez le modèle biologique .XML à l'aide d'un browser (Firefox, Chrome,...) ou d'un éditeur de texte comme Notepad++.
-  * Identifiez le stade et les valeur définissant les courbes (H,V,S) par exemple pour la hauteur d'eau d'un stade adulte :
+  * Identifiez le stade et les valeur définissant les courbes (H,V,S), par exemple pour la hauteur d'eau d'un stade adulte :
     <Stage Type="adult">
       <PreferenceHeightOfWater>
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 Vérifiez enfin la valeur d'habitat de la maille $\mathit{HSI}$  en utilisant l'équation (1).
+Vous pouvez aussi vérifier les résultats globaux de la simulation hydraulique à partir de la table attributaire du maillage et des équations (2) et (3).
 Précisions:
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             <PreferenceSubstrate>
-               <SubstrateValues ClassificationName="Code EVHA 2.0 (GINOT 1998)" Variables="__Dominant__">s1 s2 s3 s4 s5 s6 s7 s8</SubstrateValues>
+               <SubstrateValues ClassificationName="Code EVHA 2.0 (GINOT 1998)" Variables="Dominant">s1 s2 s3 s4 s5 s6 s7 s8</SubstrateValues>
                <PreferenceValues>0.35 0.35 0.35 0.35 0.61 0.77 1 0.91</PreferenceValues>
             </PreferenceSubstrate>